גרסאות רבות נעשו לסיפורה של אליס בארץ הפלאות ובהן קו עלילה מוכר וידוע: אליס מגיעה בתור ילדה לארץ הפלאות, פוגשת טיפוסים מוזרים כגון: הארנב הלבן, הכובען המטורף, הזחל המעשן, המלכה האדומה והרעה ועוד. לבסוף, מגלה אליס שהביקור בארץ הפלאות היה בעצם חלום. בגרסתו של הבמאי טים ברטון לסיפורה של אליס, אנו פוגשים את רוב הדמויות מהגרסאות הקודמות לסיפורה של אליס, אך העלילה סביב אותן דמויות השתנתה.
בגרסתו של טים ברטון, אליס ביקרה בארץ הפלאות בתור ילדה, אך שכחה כי זה קרה. היא חולמת על ארץ הפלאות מאז אותו ביקור, עד שהיא מגיעה לגיל 19. אביה של אליס, שאותו שיתפה אליס בחלומותיה ואליו הייתה קרובה מאוד, נפטר ואמה מעוניינת שהיא תתחתן עם בן אצולה כמו שעושות כל בנות גילה. אליס אינה מעוניינת להתחתן ובמקרה, היא מוצאת את המערה של הארנב הלבן ונכנסת לתוכה. דרך המערה, אליס מגיעה לארץ הפלאות ופוגשת את כל הדמויות שפגשה בילדותה. בהתחלה, אליס חושבת כי היא חולמת חלום, אך במהלך הסרט, היא מבינה שזהו אינו חלום וכי גם ביקורה בארץ הפלאות כילדה היה אמיתי. אליס מגלה שהמלכה האדומה השתלטה על ארץ הפלאות והרסה אותה. תושבי ארץ הפלאות טוענים שישנה נבואה ולפיה תבוא אליס ותהרוג את הג'ברוואקי, הדרקון של המלכה האדומה ובכך תביא לקץ שלטון האימים של המלכה האדומה ותחזיר את המלוכה לאחותה, המלכה הלבנה.
הסרט משלב שחקנים חיים עם דמויות ממוחשבות, המדובבות על ידי שחקנים. הסרט נעשה בטכנולוגיית תלת מימד, שגורמת לצופים לחוות את הצפייה בסרט, כאילו שהם נמצאים בתוכו. לרוב, סרט המשתמש בטכנולוגיית התלת מימד, גורם לכך שהטכנולוגיה מקשה על הצופה להבין את העלילה והמסרים שבסרט. הצופה מתרכז באפקטים של התלת מימד, במקום להתרכז במרכיבי העלילה. לדעתי, זו הייתה טעות ליצור את הסרט בתלת מימד.
חסרון נוסף של הסרט הוא שהדמויות, מלבד דמותה של המלכה האדומה ודמותה של אליס, הינן שטחיות למדי ואינן מתפתחות לשום כיוון. הצופים מקבלים מידע מועט על דמויות אלו. דמויות אלו אינן אופייניות לדמויות המורכבות שבסרטיו האחרים של ברטון. ייתכן שזה מתקשר לעובדה שחברת דיסני הפיקה את הסרט. סרטי דיסני פונים לקהל הילדים, בעיקר. יתכן שחברת דיסני לא רצתה להעמיס על הילדים דמויות רבות ומורכבות, כדי שלא יתקשו להבין את העלילה ואת הסרט עצמו ולכן רוב הדמויות אינן מורכבות.
דמויותיהן של אליס ושל המלכה האדומה, כאמור, מורכבות ובעלות עומק, יחסית לשאר הדמויות. הצופים מגלים פרטים רבים אודותיהן. אליס היא נערה בת 19 החיה בתקופה הויקטוריאנית ובה נהוג שכל נערה מתחתנת צעירה ורצוי עם בן אצולה. אליס היא נערה דעתנית, ביקורתית כלפי המנהגים הנהוגים באותה תקופה. לדוגמא: באחת הסצנות, אליס שואלת את אמה מי קבע שנשים צריכות להתלבש בצורה מסוימת ושעתידן הוא להיות רעיות ואימהות צעירות. אליס מעוניינת בדברים שהם מעבר לייעודה של אישה באותה תקופה. היא רוצה לראות עולם, לפתח קריירה ולא להתחתן בגיל צעיר. אליס היא נערה פמיניסטית וכלל לא מתנהגת כמו נערה טיפוסית לאותה התקופה.
המלכה האדומה היא אחותה הקטנה של המלכה הלבנה. בתחילת הסרט ידוע לצופים כי המלכה האדומה השתלטה על הכתר של המלכה הלבנה והרסה את ארץ הפלאות. המלכה האדומה רודה בכל תושבי ארץ הפלאות. היא צעקנית, קפריזית, פוקדת לערוף את ראשם של כל אלו שמעצבנים אותה. לקראת סוף הסרט, המלכה האדומה מתוודה בפני המלכה הלבנה, כי היא תמיד קינאה בה על שקיבלה תמיד מה שהיא רצתה. המלכה האדומה הרגישה שהוריה קיפחו אותה בילדותה ונתנו למלכה הלבנה מה שרצתה. המלכה האדומה חיפשה אהבה בזרועותיו של נסיך הלבבות, אך כשהיא ונסיך הלבבות מובסים על ידי אליס ועונשם הוא לצאת יחד לגלות, הנסיך אומר למלכה האדומה כי הוא אינו סובל אותה ובכך מפר את האמון שנתנה בו.
ישנו מסר פמיניסטי בסרט, הבא לידי ביטוי בכך שאישה שולטת בארץ הפלאות. כל הגברים בארץ הפלאות נמצאים בדרגות נמוכות יותר. ביטוי נוסף של המסר הפמיניסטי הוא דמותה של אליס. אליס לא רוצה להתחתן כמו בנות גילה באותה תקופה. היא מחפשת משמעות אחרת לחייה. אליס היא גם זו שהורגת את הדרקון של המלכה האדומה. בסצנה שבה אליס נלחמת בדרקון, היא לבושה בשריון אבירים גברי, אך עדיין נראית נשית.
מסר נוסף הבא לידי ביטוי בסרט הוא שבן אדם צריך להאמין בעצמו. להאמין שהוא יכול לעשות משהו שנראה לו קשה לביצוע, או שכולם אומרים לו שהוא לא יצליח בו. אליס למדה לקראת סוף הסרט, שהיא מסוגלת לנצח את הדרקון ולהחזיר את השלטון למלכה הלבנה, אם תאמין בעצמה. אליס האמינה בעצמה גם כשעמדה מול בן האצולה שהציע לה נישואים ואמרה לו שהיא לא מעוניינת להתחתן איתו, בניגוד למה שכולם מצפים ממנה. היא הלכה עם החלום שלה ובסוף הסרט נוסעת ברחבי העולם עם שותפו של אביה בתור מתלמדת בחברה שלו.
השחקנים שיחקו טוב, למרות שרוב הדמויות לא היו מאתגרות. משחקה של הלנה בונהם קרטר בתור המלכה האדומה היה מצוין. בנוסף, אני צופה למיה ואסיקובסקה, שחקנית בתחילת דרכה, שגילמה את דמותה של אליס קריירת משחק ארוכה ומוצלחת.
סרט זה אינו מהסרטים המוצלחים ביותר של טים ברטון, יש לו מספר מגרעות, אך הוא בעל מסרים. כמו כן, הסרט מעורר עניין בעיקר בקרב הילדים, אך גם צעירים ומבוגרים יכולים ליהנות ממנו.