האירידיולוגיה טוענת שכל מחלה נוצרת מפסולת הגורמת לחוסר איזון באיברים ובמערכות השונות בגוף
פסולת פיזית נובעת מתזונה לקויה, תרופות, זיהום אויר, כימיקלים.
פסולת רגשית נובעת מ: כעסים, פחדים, יצרים לא מאוזנים, קינאה ועוד.
קיים קשר בלתי ניתן להפרדה בין הגוף לנפש. מחשבה יוצרת רגש ורגש ישפיע מאוחר יותר בגוף הפיזי. ניקח לדוגמא מצב שבו קיימת אצל האדם מחשבה שלילית כלשהי כמו "אני לא אעמוד במשימה", מחשבה זו תביא להרגשת פחד והפחד יגרום לכיווץ הבטן שיגרום לכאבים. מאוד פשוט. זוהי דוגמא מאוד אופיינית להרגשת פחד שבאה כמובן בעקבות מחשבה. לכן יש צורך לרפא את מכלול ההיבטים המהווים את האדם.
על פי האירידיולוגיה איברים "מדברים" רגשית. כשאנו לא מקשיבים להם הם מאותתים לנו בכאב פיזי.
בעיות במערכת העיכול, נובעות מחוסר היכולת שלנו לעכל או להתמודד עם החיים. מומחים רבים מציינים שמחלת המאה היא עצירות. לפי האירידיולוגיה מדובר בעצם בעצירות רגשית, ואין ספק שהסתכלות שונה על החיים תקל על מערכת העיכול שלנו.
כאבים בשלד, מצביעים בין השאר על חוסר גמישות של האדם כלפי עצמו וכלפי הסביבה. כאשר מופיעים סימנים בעמוד השדרה, הדבר יכול להצביע על חולשה מסיבות פיזיולוגיות שונות - עקמת, אוסטיאופורוזיס, פריצת דיסק, שחיקת סחוסים וכד - אבל כשמתבוננים במפה הרגשית של העין, ניתן לראות שהאזור הזה בקשתית מסמל את הגמישות והנוקשות של האדם בחייו.
דלקות גרון חוזרות ונשנות הן סימפטום נפוץ אצל ילדים, אזור הגרון מסמל את יכולת ביטוי הרגשות. הרבה ילדים שסבלו בצעירותם מכאבי גרון ומדלקות חוזרות ונשנות גילו שברגע שעמדו ברשות עצמם והיו בעלי יכולת לבחור ולהשמיע את קולם, הכאבים נעלמו.
"דלקות גרון על רקע ויראלי והחיידק סטרפטוקוקוס אינן בוחרות סתם ככה להתארח בגרון. כשזה קורה, מדובר במקרה של חסך רגשי, וללא טיפול הולם, הכאב בגרון יחזור שוב ושוב. אדם המתקשה לבטא את עצמו מרגיש מנוכר לסביבתו בגלל התחושה שהאנשים הקרובים אליו אינם מבינים או מקבלים אותו. צריך לאפשר לו לבטא רגשות - בציור, שירה, תנועה, כתיבה - אחרת יתפתחו בעיות גרון. הסיבה שכאבי גרון חוזרים תוקפים דווקא ילדים בגילאים הצעירים היא חוסר היכולת שלהם להתבטא כפי שהיו רוצים. לכן יש צורך לתת לילדים להתבטא בכל תחומי החיים ולאפשר להם להיות מה שנועדו להיות.
הסימנים בעין באים להבהיר לנו מהי העבודה הרגשית המשמעותית של האדם בחייו.
ההתמודדויות הרגשיות שלנו הם המאתגרות אותנו בחיים. העבודה הרגשית אם כן, היא זו שתמנע את המחלות והחולשות הגופניות של האדם.